Biochémia
Portál obsahuje 49 diplomových prác z odboru Biochémia
Biochémia
Alternatívne štruktúrne motívy vyskytujúce sa v DNA repetitívnych sekvenciách bohatých na G+C bázové páry (2008 | pridané 1. júna 2008)
Ľuboš Bauer; Školiteľ: RNDr. Viktor Víglaský, PhD.
Na guanín bohaté sekvencie v DNA môžu nadobúdať neobyčajné Non-B DNA štruktúry, zvané G-kvadruplexová DNA. Variácie v molekularite, topológii, orientácií vlákien a glykozidickej konformácii v G-kvadruplexovej DNA sprostredkúvajú vznik rozličných konformácií tejto štruktúry.
Univerzita Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach » Prírodovedecká fakulta » Katedra biochémie | PRÍRODNÉ VEDY » Chemické vedy » Biochémiahlasov Dostupný celý text práce: PDFCharakterizácia interakcie NADH oxidázy z Thermus thermophilus so substrátom. (2007 | pridané 4. júna 2007)
Petra Vasiľková; Školiteľ: doc. RNDr. Erik Sedlák, PhD
Táto práca je zameraná predovšetkým na štúdium interakcie NADH oxidázy so substrátom a to inhibovaním enzýmu jednotlivými časťami NADH ako aj produktom prvej polreakcie (NAD+, kyselina nikotínová, nikotínamid, AMP, ADP). Enzým interaguje s týmito časťami s rôznou afinitou. Takéto rozdelenie afinít k jednotlivým podštruktúram substrátu umožňuje efektívnu asociáciu substrátu a disociáciu produktu.
Univerzita Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach » Prírodovedecká fakulta » Iná katedra | PRÍRODNÉ VEDY » Chemické vedy » Biochémiahlasov Dostupný celý text práce: PDFAnalýza rôznych spôsobov deflavinizácie glukózaoxidázy z Aspergillus niger (2007 | pridané 26. mája 2007)
Lenka Bryndzová; Školiteľ: doc.RNDr.Erik Sedlák, PhD
V tejto práci boli analyzované štyri deflavinizačné metódy s rozdielnym rozsahom chemických modifikácii. Efektívnosť a reprodukovateľnosť jednotlivých deflavinizačných postupov bola porovnaná na glukózaoxidáze z Aspergillus niger. Išlo konkrétne o metódy využívajúce chlorid vápenatý, síran amónny, bromid draselný a tiokyanatan draselný ako deflavinizačné činidlá.
Univerzita Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach » Prírodovedecká fakulta » Katedra biochémie | PRÍRODNÉ VEDY » Chemické vedy » BiochémiahlasovStabilita proteínov izolovaných z termofilných mikroorganizmov (2000 | pridané 9. augusta 2005)
Jana Tkáčová; Školiteľ: ? ?
Študovali sme vplyv pH, iónovej sily a polyaniónov (heparín, PVS, PSS) na stabilitu/štruktúru elongačných faktorov EF-Tu, EF-Ts z Thermus thermophilus. Problém bol sledovaný pomocou UV- absorpčnej spektroskopie, fluorescencie a diferenčnej kompenzačnej kalorimetrie.
Univerzita Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach » Prírodovedecká fakulta » Katedra biochémie | PRÍRODNÉ VEDY » Chemické vedy » BiochémiahlasovRegulácia génovej expresie u bakteriálneho kmeňa Streptococcus bovis JB1 (2000 | pridané 9. augusta 2005)
Richard Malík; Školiteľ: ? ?
Kyvadlový vektor pVA838 schopný replikácie v E. coli a S. bovis sa používa na vyhľadávanie promótorov na klonovaných úsekoch génov pochádzajúcich zo streptokokov. Nesie gény rezistencie voči chloramfenikolu a erytromycínu, ktoré slúžia ako markery transformovaných buniek týmto vektorom.
Univerzita Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach » Prírodovedecká fakulta » Katedra biochémie | PRÍRODNÉ VEDY » Chemické vedy » BiochémiahlasovCharakterizácia komplexov Proteín-nukleová kyselina (2000 | pridané 9. augusta 2005)
Silvia Kočanová; Školiteľ: ? ?
Študovali sme plazmid pKRS 3 s palindromickou sekvenciou a tvorbu alternatívnej štruktúry. Alternatívna štruktúra bola stanovená na základe špecificky viažuceho sa proteínu S1 nukleázy. Tento problém sme sledovali dvojdimenzionálnou elektroforézou. Táto metóda umožňuje separáciu nižších DNA topoizomérov od vyšších (tvoriacich alternatívnu štruktúru), ktoré pri jednoduchej elektroforéze komigrujú.
Univerzita Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach » Prírodovedecká fakulta » Katedra biochémie | PRÍRODNÉ VEDY » Chemické vedy » BiochémiahlasovVplyv vybraných látok na teplotnú stabilitu plazmidovej DNA (2001 | pridané 9. augusta 2005)
Ivana Vasilenková; Školiteľ: ? ?
Na štúdium teplotnej stability a distribúcie plazmidov pUC19 a pRES3 izolovaných z bakteriálnych buniek E. coli, kultivovaných pri rôznych teplotách, bola použitá dvojdimenzionálna elektroforéza (2D) a teplotná gradientová gélová elektroforéza (TGGE). Plazmidová DNA sa v bunkách nachádza v početných formách negatívneho superhélixu. Zmes DNA topizomérov reprezentuje systém citlivý na zmenu teploty.
Univerzita Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach » Prírodovedecká fakulta » Katedra biochémie | PRÍRODNÉ VEDY » Chemické vedy » BiochémiahlasovDetekcia a identifikácia beta-laktamáz ESBL produkovaných kmeňom Klebsiella pneumoniae u imunokompresívnych pacientov (2001 | pridané 9. augusta 2005)
Viliam Štovčík; Školiteľ: ? ?
Táto štúdia bola uskutočnená za účelom zistiť, ktoré typy rozšíreného spektra β-laktamáz (ESBL) produkuje taký patogén, akým je Klebsiella pneumoniae. Na detekciu a identifikáciu ESBL typov sa použilo 20 zo 62 klinických izolátov produkujúcich ESBL. Izoláty boli získané zo štyroch rôznych nemocničných oddelení (chirurgie, neurochirurgie, pediatrie a JIS) Fakultnej nemocnice v Košiciach.
Univerzita Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach » Prírodovedecká fakulta » Katedra biochémie | PRÍRODNÉ VEDY » Chemické vedy » BiochémiahlasovOptimalizácia chromatografických metód pri identifikácií kannabinoidov a amfetamínových derivátov (2001 | pridané 9. augusta 2005)
Ladislav Somogyi; Školiteľ: ? ?
Vzhľadom na štatistické údaje a potreby laboratória je optimalizovať metódy pri identifikácií kannabionoidov a amfetamínových derivátov Na identifikáciu kannabinoidov a amfetamínových derivátov sa najčastejšie využívajú rôzne imunochemické metódy, ktoré sú rýchle, jednoduché na prevedenie, ale nešpecifické a ekonomicky náročné.
Univerzita Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach » Prírodovedecká fakulta » Katedra biochémie | PRÍRODNÉ VEDY » Chemické vedy » BiochémiahlasovVplyv vonkajších podmienok na stabilitu tRNA (2001 | pridané 9. augusta 2005)
Jana Schmuczerová; Školiteľ: ? ?
Študovali sme vplyv Mg2+ iónov na termálnu stabilitu tRNA molekúl. Teoretické a experimentálne štúdia ukázali, že tieto RNA molekuly sú silne závislé od iónových podmienok. Pri sledovaní zmien v štruktúre RNA molekúl vplyvom horečnatých iónov bola využitá UV spektrálna analýza a teplotná gradientová gélová elektroforéza (TGGE).
Univerzita Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach » Prírodovedecká fakulta » Katedra biochémie | PRÍRODNÉ VEDY » Chemické vedy » Biochémiahlasov